Участник:DenisAnuprienko/Метод Штрассена: различия между версиями
| (не показано 13 промежуточных версий этого же участника) | |||
| Строка 77: | Строка 77: | ||
== Последовательная сложность алгоритма == | == Последовательная сложность алгоритма == | ||
Метод | Метод Штрассена позволяет сократить число умножений, поэтому оценивается именно оно. В методе Штрассена число умножений составляет <math>O(7^{log_2N}) = O(N^{log_27}) \approx O(N^{2.81})</math>. | ||
== Информационный граф == | == Информационный граф == | ||
Рассмотрим блок-схему для последовательной реализации рекурсивной функции Strassen | Рассмотрим блок-схему для последовательной реализации рекурсивной функции Strassen для числа <math>N_{min}</math>, равного 512. | ||
[[Файл:Serial.png|300px|center]] | [[Файл:Serial.png|300px|center]] | ||
Здесь 7 рекурсивных вызовов функции Strassen можно выполнять параллельно: | Здесь 7 рекурсивных вызовов функции Strassen можно выполнять параллельно: | ||
[[Файл: | [[Файл:Parallel_1.png|600px|center]] | ||
== Ресурс параллелизма алгоритма == | == Ресурс параллелизма алгоритма == | ||
Умножения, которые необходимы для нахождения матриц <math>M_1, ..., M_7</math>, можно провести параллельно. Их можно предоставить 7 | Умножения, которые необходимы для нахождения матриц <math>M_1, ..., M_7</math>, можно провести параллельно. Их можно предоставить 7 процессам (1 хозяин, который раздает задания 6 рабочим и получает результаты, а также работает вместе с рабочими) или 8 процессам (1 хозяин, который раздает задания 7 рабочим и получает результаты). | ||
== Входные и выходные данные алгоритма == | == Входные и выходные данные алгоритма == | ||
Нет никаких предположений насчет структуры матриц. | Нет никаких предположений насчет структуры матриц. Считается, что это обычные плотные матрицы. Они хранятся в виде одномерного массива, что позволяет легко выделять из них подматрицы. | ||
== Свойства алгоритма == | == Свойства алгоритма == | ||
| Строка 104: | Строка 104: | ||
== Особенности реализации последовательного алгоритма == | == Особенности реализации последовательного алгоритма == | ||
Матрицы хранятся как одномерные массивы. Благодаря этому в составе матрицы легко выделить подматрицу, зная размеры подматрицы и родительской матрицы, а также указатель на начало подматрицы.<br> | |||
В этом состоит выгодное отличие от некоторых существующих реализаций, где при использовании подматриц выделяется отдельная память. | |||
== Локальность данных и вычислений == | == Локальность данных и вычислений == | ||
| Строка 110: | Строка 112: | ||
== Возможные способы и особенности параллельной реализации алгоритма == | == Возможные способы и особенности параллельной реализации алгоритма == | ||
Устройство метода Штрассена накладывает ограничения на количество | Устройство метода Штрассена накладывает ограничения на количество процессов для распараллеливания. | ||
* Как уже было отмечено, распараллеливать можно 7 умножений, из которых получаются матрицы <math>M_1, ..., M_7</math>, с помощью 7 или 8 процессов. | * Как уже было отмечено, распараллеливать можно 7 умножений, из которых получаются матрицы <math>M_1, ..., M_7</math>, с помощью 7 или 8 процессов. | ||
* Распараллеливание этих 7 умножений с помощью меньшего, чем 7, или большего, чем 8, числа процессов не рассматривается, так как в первом случае количество пересылок будет тем же, а время работы - большим, а во втором случае получается более 1 процесса на 1 умножение, что является дополнительным усложнением с негарантированной пользой. | * Распараллеливание этих 7 умножений с помощью меньшего, чем 7, или большего, чем 8, числа процессов не рассматривается, так как в первом случае количество пересылок будет тем же, а время работы - большим, а во втором случае получается более 1 процесса на 1 умножение, что является дополнительным усложнением с негарантированной пользой. | ||
* В таком случае, распараллеливание <math>n</math> уровней рекурсии требует как минимум <math>7^n</math> | * В таком случае, распараллеливание <math>n</math> уровней рекурсии требует как минимум <math>7^n</math> процессов. Количество процессов меняется тогда и только тогда, когда меняется число распараллеливаемых уровней рекурсии. | ||
* Здесь будет рассмотрен вариант метода Штрассена, где распараллеливается '''1''' уровень рекурсии с помощью 8 процессов: 1 хозяина и 7 рабочих. Эта версия работает несколько быстрее, чем версия с 7 процессами. | * Здесь будет рассмотрен вариант метода Штрассена, где распараллеливается '''1''' уровень рекурсии с помощью 8 процессов: 1 хозяина и 7 рабочих. Эта версия работает несколько быстрее, чем версия с 7 процессами. | ||
== Масштабируемость алгоритма и его реализации == | == Масштабируемость алгоритма и его реализации == | ||
По описанным в предыдущем пункте причинам предлагаемая реализация с распараллеливанием 1 уровня рекурсии может быть запущена только на определенном количестве | По описанным в предыдущем пункте причинам предлагаемая реализация с распараллеливанием 1 уровня рекурсии может быть запущена только на определенном количестве процессов. Запуск на другом количестве процессов означает использование уже другой программы, поэтому оценить масшатбируемость в текущей реализации не представляется возможным. | ||
=== Сравнение работы последовательной и параллельной реализаций === | |||
Эксперименты проводились на суперкомпьютере [http://users.parallel.ru/wiki/pages/22-config "Ломоносов"]. Использовались gcc и mpicc 4.4.7 с флагом компиляции -O3, а также OpenMPI 1.8.4. Параллельная версия задействовала 8 процессов. | |||
{| class="wikitable" | |||
|+Результаты запусков на "Ломоносове" | |||
|- | |||
|Размер матрицы | |||
|Последовательная реализация | |||
|Параллельная реализация с использованием MPI | |||
|Ускорение | |||
|- | |||
|512 | |||
|0.18 c | |||
|0.035 c | |||
|5.14 | |||
|- | |||
|1024 | |||
|1.99 c | |||
|0.40 c | |||
|4.98 | |||
|- | |||
|2048 | |||
|16.1 c | |||
|3.45 c | |||
|4.67 | |||
|- | |||
|4096 | |||
|230.1 c | |||
|71.0 c | |||
|3.23 | |||
|- | |||
|} | |||
== Динамические характеристики и эффективность реализации алгоритма == | == Динамические характеристики и эффективность реализации алгоритма == | ||
Текущая версия от 09:44, 10 декабря 2016
Основные авторы описания: Д.В.Ануприенко.
Свойства и структура алгоритмов
Общее описание алгоритма
Метод Штрассена предназначен для умножения матриц. Здесь будет рассмотрен вариант метода, который можно применять к квадратным матрицам размера [math]\displaystyle{ N = 2^n }[/math]. В таком случае две матрицы можно умножить быстрее, чем за [math]\displaystyle{ O(N^3) }[/math].
Математическое описание алгоритма
Пусть имеются две матрицы [math]\displaystyle{ A, B \in \mathbb{R}^{N\times N} }[/math]. Представим их в блочном виде:
[math]\displaystyle{
A =
\begin{bmatrix}
A_{11} & A_{12}\\
A_{21} & A_{22}\\
\end{bmatrix},
B =
\begin{bmatrix}
B_{11} & B_{12}\\
B_{21} & B_{22}\\
\end{bmatrix}.
}[/math]
При обычном умножении матриц пришлось бы совершить 8 умножений подматриц порядка [math]\displaystyle{ N/2 }[/math]. В методе Штрассена предлагается обойтись всего 7 умножениями. Находятся 7 вспомогательных подматриц [math]\displaystyle{ M_1, ..., M_7 }[/math] по следующим формулам:
[math]\displaystyle{
M_1 = (A_{11} + A_{22})(B_{11} + B_{22})
}[/math]
[math]\displaystyle{
M_2 = (A_{21} + A_{22})B_{11}
}[/math]
[math]\displaystyle{
M_3 = A_{11}(B_{12} - B_{22})
}[/math]
[math]\displaystyle{
M_4 = A_{22}(B_{21} - B_{11})
}[/math]
[math]\displaystyle{
M_5 = (A_{11} + A_{12})B_{22}
}[/math]
[math]\displaystyle{
M_6 = (A_{21} - A_{22})(B_{11} + B_{12})
}[/math]
[math]\displaystyle{
M_7 = (A_{12} - A_{22})(B_{21} + B_{22})
}[/math]
После этого матрица [math]\displaystyle{ C }[/math], являющаяся произведением [math]\displaystyle{ A }[/math] и [math]\displaystyle{ B }[/math], находится по формулам
[math]\displaystyle{
C_{11} = M_1 + M_4 - M_5 + M_7
}[/math]
[math]\displaystyle{
C_{12} = M_3 + M_5
}[/math]
[math]\displaystyle{
C_{21} = M_2 + M_4
}[/math]
[math]\displaystyle{
C_{22} = M_1 - M_2 + M_3 + M_6
}[/math]
Если и умножения подматриц, необходимые для нахождения [math]\displaystyle{ M_i }[/math], проводить по такой же схеме, получается рекурсивный алгоритм. Всего в нем понадобится выполнить [math]\displaystyle{ O(7^{log_2N}) = O(N^{log_27}) \approx O(N^{2.81}) }[/math] умножений. На практике рекурсию можно не разворачивать до конца, а использовать обычное умножение уже на матрицах размера 512.
[math]\displaystyle{ }[/math]
Вычислительное ядро алгоритма
Основное время работы алгоритма приходится на формирование множителей для умножения подматриц, рекурсивные вызовы и умножение матриц обычным методом в конце рекурсии.
Макроструктура алгоритма
Схема реализации последовательного алгоритма
- Если размер матриц меньше некоторого числа [math]\displaystyle{ N_{min} }[/math], умножить их обычным способом.
- Иначе
- Сформировать множители для матрицы [math]\displaystyle{ M_1 }[/math]
- Применить метод Штрассена для этих множителей
- Сформировать множители для матрицы [math]\displaystyle{ M_2 }[/math]
- Применить метод Штрассена для этих множителей
- ...
- Сформировать множители для матрицы [math]\displaystyle{ M_7 }[/math]
- Применить метод Штрассена для этих множителей
- Сформировать результат из матриц [math]\displaystyle{ M_1, ..., M_7 }[/math].
Последовательная сложность алгоритма
Метод Штрассена позволяет сократить число умножений, поэтому оценивается именно оно. В методе Штрассена число умножений составляет [math]\displaystyle{ O(7^{log_2N}) = O(N^{log_27}) \approx O(N^{2.81}) }[/math].
Информационный граф
Рассмотрим блок-схему для последовательной реализации рекурсивной функции Strassen для числа [math]\displaystyle{ N_{min} }[/math], равного 512.

Здесь 7 рекурсивных вызовов функции Strassen можно выполнять параллельно:

Ресурс параллелизма алгоритма
Умножения, которые необходимы для нахождения матриц [math]\displaystyle{ M_1, ..., M_7 }[/math], можно провести параллельно. Их можно предоставить 7 процессам (1 хозяин, который раздает задания 6 рабочим и получает результаты, а также работает вместе с рабочими) или 8 процессам (1 хозяин, который раздает задания 7 рабочим и получает результаты).
Входные и выходные данные алгоритма
Нет никаких предположений насчет структуры матриц. Считается, что это обычные плотные матрицы. Они хранятся в виде одномерного массива, что позволяет легко выделять из них подматрицы.
Свойства алгоритма
- Алгоритм устойчив
- Алгоритм детерминирован
Программная реализация алгоритма
Исходный код
Особенности реализации последовательного алгоритма
Матрицы хранятся как одномерные массивы. Благодаря этому в составе матрицы легко выделить подматрицу, зная размеры подматрицы и родительской матрицы, а также указатель на начало подматрицы.
В этом состоит выгодное отличие от некоторых существующих реализаций, где при использовании подматриц выделяется отдельная память.
Локальность данных и вычислений
Все действия с двумя главными матрицами проводит только процесс-хозяин. Каждый процесс также создает и освобождает для себя вспомогательные матрицы [math]\displaystyle{ M_i }[/math], а также две матрицы для записи множителей для нахождения [math]\displaystyle{ M_i }[/math].
Возможные способы и особенности параллельной реализации алгоритма
Устройство метода Штрассена накладывает ограничения на количество процессов для распараллеливания.
- Как уже было отмечено, распараллеливать можно 7 умножений, из которых получаются матрицы [math]\displaystyle{ M_1, ..., M_7 }[/math], с помощью 7 или 8 процессов.
- Распараллеливание этих 7 умножений с помощью меньшего, чем 7, или большего, чем 8, числа процессов не рассматривается, так как в первом случае количество пересылок будет тем же, а время работы - большим, а во втором случае получается более 1 процесса на 1 умножение, что является дополнительным усложнением с негарантированной пользой.
- В таком случае, распараллеливание [math]\displaystyle{ n }[/math] уровней рекурсии требует как минимум [math]\displaystyle{ 7^n }[/math] процессов. Количество процессов меняется тогда и только тогда, когда меняется число распараллеливаемых уровней рекурсии.
- Здесь будет рассмотрен вариант метода Штрассена, где распараллеливается 1 уровень рекурсии с помощью 8 процессов: 1 хозяина и 7 рабочих. Эта версия работает несколько быстрее, чем версия с 7 процессами.
Масштабируемость алгоритма и его реализации
По описанным в предыдущем пункте причинам предлагаемая реализация с распараллеливанием 1 уровня рекурсии может быть запущена только на определенном количестве процессов. Запуск на другом количестве процессов означает использование уже другой программы, поэтому оценить масшатбируемость в текущей реализации не представляется возможным.
Сравнение работы последовательной и параллельной реализаций
Эксперименты проводились на суперкомпьютере "Ломоносов". Использовались gcc и mpicc 4.4.7 с флагом компиляции -O3, а также OpenMPI 1.8.4. Параллельная версия задействовала 8 процессов.
| Размер матрицы | Последовательная реализация | Параллельная реализация с использованием MPI | Ускорение |
| 512 | 0.18 c | 0.035 c | 5.14 |
| 1024 | 1.99 c | 0.40 c | 4.98 |
| 2048 | 16.1 c | 3.45 c | 4.67 |
| 4096 | 230.1 c | 71.0 c | 3.23 |