Уровень алгоритма

Участник:Demon smd/Нечеткий алгоритм С средних: различия между версиями

Материал из Алговики
Перейти к навигации Перейти к поиску
Нет описания правки
Нет описания правки
Строка 17: Строка 17:
и усовершенствован (для случая m>1)  
и усовершенствован (для случая m>1)  
J.C. Bezdek в 1981 г. <ref>Bezdek, James C. (1981). Pattern Recognition with Fuzzy Objective Function Algorithms. ISBN 0-306-40671-3.</ref>  
J.C. Bezdek в 1981 г. <ref>Bezdek, James C. (1981). Pattern Recognition with Fuzzy Objective Function Algorithms. ISBN 0-306-40671-3.</ref>  
. В отличие от алгоритма c-means Данный метод кластеризации предполагает, что входные данные могут принадлежать более, чем одному кластеру одновременно.
. В отличие от алгоритма c-means данный метод кластеризации предполагает, что входные данные могут принадлежать более, чем одному кластеру одновременно.
Алгоритм получает на вход набор кластеризируемых векторов, количество кластеров, коэффициент неопределённости m и коэффициент <math>\varepsilon > 0</math>, определяющий точность алгоритма. На выходе алгоритма получаем матрицу вероятностей принадлежности каждого входного вектора каждому кластеру.
Алгоритм получает на вход набор кластеризуемых векторов, количество кластеров, коэффициент неопределённости m и коэффициент <math>\varepsilon > 0</math>, определяющий точность алгоритма. На выходе алгоритма получаем матрицу вероятностей принадлежности каждого входного вектора каждому кластеру.


Нечеткий алгоритм С средних для каждого вектора определяет случайным образом значения принадлежности вектора к каждому кластеру и запускает итерационный процесс, на каждой итерации которого происходит:
Нечеткий алгоритм С средних заключается в следующем. Изначально для каждого вектора определяется случайным образом вероятность принадлежности вектора к каждому кластеру. Далее запускается итерационный процесс, на каждой итерации которого происходит:


1) Расчёт центров кластеров.
1) расчёт центров кластеров


2) Расчёт Евклидова расстояния от каждого вектора до центра каждого кластера  
2) расчёт Евклидова расстояния от каждого вектора до центра каждого кластера  


3) Расчёт и нормализация коэффициентов принадлежности векторов кластерам
3) расчёт и нормализация коэффициентов принадлежности векторов кластерам


4) Расчёт значения решающей функции и сравнение этого значения со значением решающей функции на предшествующей итерации.Если их разница меньше установленного значения, то алгоритм прекращает работу. Решающая функция возвращает сумму всех Евклидовых расстояний каждого объекта к каждому центру кластера умноженному на коэффициент принадлежности
4) расчёт значения решающей функции и сравнение этого значения со значением решающей функции на предшествующей итерации: если разница этих значений меньше установленного значения, то алгоритм прекращает работу (решающая функция возвращает сумму всех Евклидовых расстояний каждого объекта к каждому центру кластера умноженному на коэффициент принадлежности)


=== Математическое описание алгоритма ===
=== Математическое описание алгоритма ===
Строка 34: Строка 34:
:<math>
:<math>
\begin{align}
\begin{align}
J_{m} = \sum_{i = 1}^{N}\sum_{j = 1}^{C}u_{i,j}^m\left\Vert{x_{i}-c_{j}}\right\|^2 & & , & &  1 \le m \le \infty & ; \\
J_{m} = \sum_{i = 1}^{N}\sum_{j = 1}^{C}u_{i,j}^m\left\Vert{x_{i}-c_{j}}\right\|^2 & , & &  1 \le m \le \infty , \\
\end{align}
\end{align}
</math>
</math>
где m - это действительное число не меньше единицы, <math>u_{i,j}</math> - коэффициент принадлежности вектора <math>x_{i}</math> к кластеру <math>c_{j}</math>, <math>x_{i}</math> - <math>i</math>-ый компонент <math>N</math>-мерного вектора <math>x</math>, <math>c_{j}</math>
где m - это действительное число не меньше единицы, <math>u_{i,j}</math> - коэффициент принадлежности вектора <math>x_{i}</math> к кластеру <math>c_{j}</math>, <math>x_{i}</math> - <math>i</math>-ый компонент <math>N</math>-мерного вектора <math>x</math>, <math>c_{j}</math>
- центр <math>j</math>-ого кластера, а <math>\left\Vert{*}\right\|</math> - это любая норма, определяющая расстояние от вектора до центра кластера.
- центр <math>j</math>-ого кластера, а <math>\left\Vert{*}\right\|</math> - это любая норма, определяющая расстояние от вектора до центра кластера.
Строка 51: Строка 50:
=== Вычислительное ядро алгоритма ===
=== Вычислительное ядро алгоритма ===


Из вышесказанного следует, что ядром алгоритма является вычисление нового центра кластеров, для каждого входного вектора вычисление Евклидова расстояния до центров кластеров, а также коэффициент принадлежности и вычисления решающей функции.
Ядром алгоритма является:
* вычисление новых центров кластеров
* для каждого входного вектора вычисление Евклидова расстояния до центров кластеров, а также коэффициента принадлежности кластерам
* вычисление решающей функции


=== Макроструктура алгоритма ===
=== Макроструктура алгоритма ===
Строка 132: Строка 134:
=== Ресурс параллелизма алгоритма ===
=== Ресурс параллелизма алгоритма ===


На каждом ярусе ярусно-параллельной формы алгоритма будет располагаться конечное число элементарных операций, например, взятие адреса, сложение или возведение в степень. Информационый граф из п.1.7 изображает свёрнутую ярусно-параллельную форму алгоритма. Как видно из информационного графа, Параллельная сложность вычисления центров кластеров составляет <math>O(\log_{2} C*|X|)</math>, вычисления коэффициентов принадлежности - <math>O(\log_{2} C^2*|X|)</math>, а вычисления решающей функции - не больше чем <math>O(\log_{2} C*|X|)</math>.
На каждом ярусе ярусно-параллельной формы алгоритма будет располагаться конечное число элементарных операций, например, взятие адреса, сложение или возведение в степень. Информационый граф из п.1.7 изображает свёрнутую ярусно-параллельную форму алгоритма.
 
Сложность алгоритма будем рассчитывать в предположении, что число вычислительных ядер стремится к бесконечности. Как видно из информационного графа, параллельная сложность вычисления центров кластеров составляет <math>O(\log_{2} C*|X|)</math>, вычисления коэффициентов принадлежности - <math>O(\log_{2} C^2*|X|)</math>, а вычисления решающей функции - не больше чем <math>O(\log_{2} C*|X|)</math>.


Таким образом Параллельная сложность итерации алгоритма составляет <math>O(\log_{2} C^4*|X|^3)</math>
Таким образом параллельная сложность итерации алгоритма составляет <math>O(\log_{2} C^4*|X|^3)</math>.


Так как задачи, решаемые в макроструктурах алгоритма могут быть сведены к задачам вычисления суммы элементов массива и максимального элемента массива, то на <math>i</math>-ом ярусе графа будет находиться <math>{N}\over{2^i}</math> операции, где N - количество элементов массива.
Так как задачи, решаемые в макроструктуре алгоритма могут быть сведены к задачам вычисления суммы элементов массива и максимального элемента массива, то на <math>i</math>-ом ярусе графа будет находиться <math>{N}\over{2^i}</math> операции, где N - количество элементов массива.


=== Входные и выходные данные алгоритма ===
=== Входные и выходные данные алгоритма ===
Строка 157: Строка 161:
=== Масштабируемость алгоритма и его реализации ===
=== Масштабируемость алгоритма и его реализации ===


Как видно из предыдущих пунктов, масштабируется данный алгоритм хорошо. С увеличением количества процессоров время работы падает, а с увеличением количества входных данных и количества кластеров - растёт. На рисунках приведена масштабируемость алгоритма.
Как видно из предыдущих пунктов, масштабируется данный алгоритм хорошо. С увеличением количества процессоров время работы падает, а с увеличением количества входных данных и количества кластеров - растёт. На рисунках показана масштабируемость алгоритма.
[[File:FCMCOMP1.jpg|thumb|center|1500px|Рисунок 2. Масштабируемость алгоритма. Зависимость сложности алгоритма от количества процессоров и входных данных при фиксированном количестве кластеров.]]
[[File:FCMCOMP1.jpg|thumb|center|1500px|Рисунок 2. Масштабируемость алгоритма. Зависимость сложности алгоритма от количества процессоров и входных данных при фиксированном количестве кластеров.]]
[[File:FCMCOMP2.jpg|thumb|center|1500px|Рисунок 3. Масштабируемость алгоритма. Зависимость сложности алгоритма от количества процессоров и кластеров при фиксированном количестве входных данных.]]
[[File:FCMCOMP2.jpg|thumb|center|1500px|Рисунок 3. Масштабируемость алгоритма. Зависимость сложности алгоритма от количества процессоров и кластеров при фиксированном количестве входных данных.]]

Версия от 17:15, 14 октября 2016


Нечеткий алгоритм C средних (Fuzzy C-means)
Последовательный алгоритм
Последовательная сложность [math]\displaystyle{ O(C^2*N*D*IterNumber) }[/math]
Объём входных данных [math]\displaystyle{ |X|*C }[/math]
Объём выходных данных [math]\displaystyle{ |X|*C }[/math]
Параллельный алгоритм
Высота ярусно-параллельной формы [math]\displaystyle{ O(\log_{2}C^4*|X|^3) * IterNumber }[/math]
Ширина ярусно-параллельной формы [math]\displaystyle{ O(C^2*|X|) }[/math]


Авторы описания алгоритма: Д.А.Гуськов М.А.Абраменкова

Свойства и структура алгоритма

Общее описание алгоритма

Нечёткий алгоритм кластеризации С-средних был разработан (для случая m=2) J.C. Dunn в 1973 г. [1] и усовершенствован (для случая m>1) J.C. Bezdek в 1981 г. [2] . В отличие от алгоритма c-means данный метод кластеризации предполагает, что входные данные могут принадлежать более, чем одному кластеру одновременно. Алгоритм получает на вход набор кластеризуемых векторов, количество кластеров, коэффициент неопределённости m и коэффициент [math]\displaystyle{ \varepsilon \gt 0 }[/math], определяющий точность алгоритма. На выходе алгоритма получаем матрицу вероятностей принадлежности каждого входного вектора каждому кластеру.

Нечеткий алгоритм С средних заключается в следующем. Изначально для каждого вектора определяется случайным образом вероятность принадлежности вектора к каждому кластеру. Далее запускается итерационный процесс, на каждой итерации которого происходит:

1) расчёт центров кластеров

2) расчёт Евклидова расстояния от каждого вектора до центра каждого кластера

3) расчёт и нормализация коэффициентов принадлежности векторов кластерам

4) расчёт значения решающей функции и сравнение этого значения со значением решающей функции на предшествующей итерации: если разница этих значений меньше установленного значения, то алгоритм прекращает работу (решающая функция возвращает сумму всех Евклидовых расстояний каждого объекта к каждому центру кластера умноженному на коэффициент принадлежности)

Математическое описание алгоритма

Нечеткий алгоритм С средних минимизирует величину:

[math]\displaystyle{ \begin{align} J_{m} = \sum_{i = 1}^{N}\sum_{j = 1}^{C}u_{i,j}^m\left\Vert{x_{i}-c_{j}}\right\|^2 & , & & 1 \le m \le \infty , \\ \end{align} }[/math]

где m - это действительное число не меньше единицы, [math]\displaystyle{ u_{i,j} }[/math] - коэффициент принадлежности вектора [math]\displaystyle{ x_{i} }[/math] к кластеру [math]\displaystyle{ c_{j} }[/math], [math]\displaystyle{ x_{i} }[/math] - [math]\displaystyle{ i }[/math]-ый компонент [math]\displaystyle{ N }[/math]-мерного вектора [math]\displaystyle{ x }[/math], [math]\displaystyle{ c_{j} }[/math] - центр [math]\displaystyle{ j }[/math]-ого кластера, а [math]\displaystyle{ \left\Vert{*}\right\| }[/math] - это любая норма, определяющая расстояние от вектора до центра кластера. Нечёткое разбиение входных данных на кластеры производится итеративной оптимизацией вышеуказанной функции с обновлением коэффициента принадлежности [math]\displaystyle{ u_{i,j} }[/math] и переопределением центра кластера [math]\displaystyle{ c_{j} }[/math] на каждой итерации алгоритма.

Вычисляемые данные на каждой итерации

  • Центры кластеров рассчитываются по следующей формуле: [math]\displaystyle{ c_{j} = {{\sum_{i = 1}^{n}{u_{i,j}^m} * x_{i}} \over {\sum_{i = 1}^{n}{u_{i,j}^m}}} }[/math], где [math]\displaystyle{ u_{i,j} }[/math] — коэффициент принадлежности [math]\displaystyle{ x_{i} }[/math] вектора к кластеру [math]\displaystyle{ c_{j} }[/math].
  • Коэффициент принадлежности рассчитывается по формуле: [math]\displaystyle{ u_{i,j} = {1 \over \sum_{k = 1}^{C}{({\left\Vert{x_{i}-c_{j}}\right\| \over \left\Vert{x_{i}-c_{k}}\right\|})}^{2 \over m-1}} }[/math]
  • Решающая функция рассчитывается по формуле: [math]\displaystyle{ \max_{i,j}(|u_{i,j}^{(k)} - u_{i,j}^{(k-1)}|) }[/math], где [math]\displaystyle{ k }[/math] - номер итерации алгоритма

Вычислительное ядро алгоритма

Ядром алгоритма является:

  • вычисление новых центров кластеров
  • для каждого входного вектора вычисление Евклидова расстояния до центров кластеров, а также коэффициента принадлежности кластерам
  • вычисление решающей функции

Макроструктура алгоритма

В каждой итерации алгоритма происходит 3 основных действия описанных в п. 1.2.1:

  • вычисление центров кластеров
  • вычисление коэффициентов принадлежности
  • вычисление решающей функции

Подробное описание макроструктур в виде кода приведено в пункте 1.5

Схема реализации последовательного алгоритма

Схему реализации последовательного алгоритма можно описать на C++ следующим образом:

FCM (X[], C, m, eps){
    float deside = 0;
    float newDeside = 0;
    generateMembershipDegree();            //заполняет uPrev[][] случайными нормрованными коэффициентами
    while (true){
        newDeside = deside;

        //вычисление центров кластеров
        for (int j=0; j<C; j++){           //для каждого кластера
            float numerator = 0;
            float denumerator = 0;
            for (int i=0; i<X.size(); i++){        //для каждого вектора
                numerator+=pow(u[i][j], m) * x[i];
                denumerator+=pow(u[i][j], m);
            }
            c[j] = numerator / denumerator;
        }

        //вычисление коэффициентов u[][]
        for (int i=0; i<X.size(); i++)    //для каждого вектора
            for (int j=0; j<C; j++){   //для каждого кластера
                sum = 0;
                for (int k=0; k<C; k++)
                    sum+= pow( dist(x[i], c[j]) / dist(x[i], c[k]), 2/(m-1));
                u[i][j] = 1/sum
            }

        //определения максимального различия между u[][] и uPrev[][]
        float max = 0;
        for (int i=0; i<X.size(); i++)    //для каждого вектора
            for (int j=0; j<C; j++){   //для каждого кластера
                if (abs(uPrev[i][j]-u[i][j])>max)
                    max = abs(uPrev[i][j]-u[i][j]);

        if (eps <= max)
            for (int i=0; i<X.size(); i++)    //для каждого вектора
                for (int j=0; j<C; j++){   //для каждого кластера
                    uPrev[i][j]=u[i][j];
        else
            break;
             
    }
    return u;
}

Последовательная сложность алгоритма

Последовательная сложность всего алгоритма складывается из сложности операций на каждой итерации умноженную на количество итераций. Так как в данном алгоритме количество итераций не является фиксированным и зависит от:

  • параметра [math]\displaystyle{ \varepsilon }[/math]
  • набора входных векторов [math]\displaystyle{ x }[/math]
  • выбора начальных коэффициентов [math]\displaystyle{ u }[/math]

то в данном пункте будет приведена сложность одной итерации относительно количества входных векторов. Как видно из предыдущего пункта, для вычисления центров кластеров требуется [math]\displaystyle{ O(2*C*|X|) }[/math] операций, для определения коэффициентов [math]\displaystyle{ u }[/math] - [math]\displaystyle{ O(C^2*|X|) }[/math] операций, а для вычисления решающей функции - [math]\displaystyle{ O(2*C*|X|) }[/math] операций, где [math]\displaystyle{ |X| }[/math] - число входных векторов, а [math]\displaystyle{ C }[/math] - количество кластеров.

Таким образом итоговая сложность одной итерации составляет [math]\displaystyle{ O(C^2*|X|) }[/math].

Информационный граф

Как видно из пункта 1.5, на каждом действии каждой итерации алгоритма все операции, выполняющиеся в цикле, не зависят друг от друга и могут быть распаралелены. Это показано на Рисунке 1.

Рисунок 1. Информационный граф алгоритма. (1)-(7) - это наборы последовательных действий (например, (2) - последовательные операции деления, взятия адреса и присваивания).

Ресурс параллелизма алгоритма

На каждом ярусе ярусно-параллельной формы алгоритма будет располагаться конечное число элементарных операций, например, взятие адреса, сложение или возведение в степень. Информационый граф из п.1.7 изображает свёрнутую ярусно-параллельную форму алгоритма.

Сложность алгоритма будем рассчитывать в предположении, что число вычислительных ядер стремится к бесконечности. Как видно из информационного графа, параллельная сложность вычисления центров кластеров составляет [math]\displaystyle{ O(\log_{2} C*|X|) }[/math], вычисления коэффициентов принадлежности - [math]\displaystyle{ O(\log_{2} C^2*|X|) }[/math], а вычисления решающей функции - не больше чем [math]\displaystyle{ O(\log_{2} C*|X|) }[/math].

Таким образом параллельная сложность итерации алгоритма составляет [math]\displaystyle{ O(\log_{2} C^4*|X|^3) }[/math].

Так как задачи, решаемые в макроструктуре алгоритма могут быть сведены к задачам вычисления суммы элементов массива и максимального элемента массива, то на [math]\displaystyle{ i }[/math]-ом ярусе графа будет находиться [math]\displaystyle{ {N}\over{2^i} }[/math] операции, где N - количество элементов массива.

Входные и выходные данные алгоритма

Входные данные алгоритма

  • [math]\displaystyle{ x_{i} }[/math] - набор входных векторов
  • [math]\displaystyle{ C }[/math] - количество кластеров
  • [math]\displaystyle{ m }[/math] - коэффициент неопределённости
  • [math]\displaystyle{ \varepsilon \gt 0 }[/math] - коэффициент, определяющий точность алгоритма.

Выходные данные алгоритма

  • [math]\displaystyle{ u }[/math] - матрица принадлежности векторов кластерам

Свойства алгоритма

Увеличение скорости работы алгоритма при распараллеливании на бесконечном количестве процессоров составляет [math]\displaystyle{ O({{C^2*|X|}\over{\log_{2} (C^4*|X|^3)}}) }[/math]. Например, для разбиения 1000 элементов на 10 кластеров производительность параллельного алгоритма будет в 2315 раз больше, а на 20 кластеров - уже в 8477 раз.

Программная реализация алгоритма

Масштабируемость алгоритма и его реализации

Как видно из предыдущих пунктов, масштабируется данный алгоритм хорошо. С увеличением количества процессоров время работы падает, а с увеличением количества входных данных и количества кластеров - растёт. На рисунках показана масштабируемость алгоритма.

Рисунок 2. Масштабируемость алгоритма. Зависимость сложности алгоритма от количества процессоров и входных данных при фиксированном количестве кластеров.
Рисунок 3. Масштабируемость алгоритма. Зависимость сложности алгоритма от количества процессоров и кластеров при фиксированном количестве входных данных.

Существующие реализации алгоритма

Существует множество реализаций данного алгоритма. Рассмотрим некоторые из них:

- Например, тут: https://habrahabr.ru/post/208496/ [3] приведено краткое описание алгоритма и приведена его реализация на php. В данной статье довольно подробно расписан каждый шаг алгоритма и приведён соответствующий ему фрагмент кода.

- Тут: http://num-meth.srcc.msu.ru/zhurnal/tom_2012/v13r207.html [4] приводится реализация алгоритма для PostgreSQL, а также прилагается скрипт внедрения алгоритма.

Литература

<references \>

  1. ↑ Dunn, J. C. (1973-01-01). "A Fuzzy Relative of the ISODATA Process and Its Use in Detecting Compact Well-Separated Clusters". Journal of Cybernetics. 3 (3): 32–57. doi:10.1080/01969727308546046. ISSN 0022-0280.
  2. ↑ Bezdek, James C. (1981). Pattern Recognition with Fuzzy Objective Function Algorithms. ISBN 0-306-40671-3.
  3. ↑ Нестер А. "Алгоритм нечёткой кластеризации fuzzy c-means на PHP". [html](https://habrahabr.ru/post/208496/)
  4. ↑ Миниахметов Р.М., Цымблер М.Л. "Интеграция алгоритма кластеризации Fuzzy c-Means в PostgreSQL". [html](http://num-meth.srcc.msu.ru/zhurnal/tom_2012/v13r207.html)