Алгоритм Пурдома

Материал из Алговики
Перейти к навигации Перейти к поиску

Свойства и структура алгоритма

Общее описание алгоритма

Алгоритм Пурдома[1] находит транзитивное замыкание ориентированного графа за время [math]\displaystyle{ O(m + \mu n) }[/math], где [math]\displaystyle{ \mu \le m }[/math] – число компонент сильной связности этого графа.

Математическое описание алгоритма

Алгоритм основан на следующих свойствах:

  1. Если вершины [math]\displaystyle{ v }[/math] и [math]\displaystyle{ w }[/math] принадлежат одной компоненте сильной связности графа [math]\displaystyle{ G }[/math], то его транзитивное замыкание [math]\displaystyle{ G^+ }[/math] содержит рёбра [math]\displaystyle{ (v, w) }[/math] и [math]\displaystyle{ (w, v) }[/math].
  2. Если вершины [math]\displaystyle{ x }[/math] и [math]\displaystyle{ y }[/math] принадлежат одной компоненте сильной связности графа [math]\displaystyle{ G }[/math], а вершины [math]\displaystyle{ z }[/math] и [math]\displaystyle{ t }[/math] – другой, то рёбра [math]\displaystyle{ (x, z) }[/math], [math]\displaystyle{ (x, t) }[/math], [math]\displaystyle{ (y, z) }[/math], [math]\displaystyle{ (y, t) }[/math] принадлежат или не принадлежат транзитивному замыканию [math]\displaystyle{ G^+ }[/math] одновременно.

Таким образом, поиск транзитивного замыкания графа [math]\displaystyle{ G }[/math] сводится к поиску транзитивного замыкания ациклического графа [math]\displaystyle{ \tilde G }[/math], полученного из [math]\displaystyle{ G }[/math] схлопыванием каждой компоненты сильной связности в одну вершину. Транзитивное замыкание ациклического графа вычисляется с использованием топологической сортировки вершин графа.

Вычислительное ядро алгоритма

Макроструктура алгоритма

Вычисления производятся в четыре этапа:

  1. Найти компоненты сильной связности исходного графа, заменить каждую компоненту на одну вершину и удалить образовавшиеся рёбра-петли.
  2. Выполнить топологическую сортировку полученного ациклического графа [math]\displaystyle{ \tilde G }[/math].
  3. Вычислить транзитивное замыкание графа [math]\displaystyle{ \tilde G }[/math], двигаясь от вершин с бо́льшими номерами к меньшим.
  4. По найденному транзитивному замыканию [math]\displaystyle{ \tilde G }[/math] восстановить транзитивное замыкание исходного графа.

Последний этап не является обязательным, если рассматривать транзитивное замыкание [math]\displaystyle{ \tilde G }[/math] как «упакованное» транзитивное замыкание [math]\displaystyle{ G }[/math].

Схема реализации последовательного алгоритма

1 этап (вычисление компонент сильной связности) может быть реализован алгоритмом Тарьяна[2], находящим компоненты сильной связности в ходе поиска в глубину.

2 этап (топологическая сортировка) может быть реализован алгоритмом Кана[3] либо последовательным применением поиска в глубину[2] для нумерации вершин в предпорядке.

3 этап (транзитивное замыкание [math]\displaystyle{ \tilde G }[/math]) выполняется следующим алгоритмом:

Входные данные:
    ациклический граф 'G с вершинами 'V, пронумерованными в топологическом порядке, и рёбрами E.
Выходные данные:
    для каждой вершины v ∈ V – набор вершин T(v),
        так что транзитивное замыкание G состоит из рёбер (v, w), v ∈ V, w ∈ T(v).
    
for each v ∈ V do T(v) := { v }
for v ∈ V in reverse order:
    for each (v, w) ∈ E do T(v) := T(v) ∪ T(w)

4 этап (транзитивное замыкание [math]\displaystyle{ G }[/math]) либо выполняется следующим алгоритмом:

Входные данные
    граф G с вершинами V;
    компоненты сильной связности SCC(v) графа G;
    граф [math]\displaystyle{ \tilde G }[/math] с вершинами [math]\displaystyle{ \tilde V }[/math];
    транзитивное замыкание [math]\displaystyle{ \tilde T }[/math] графа [math]\displaystyle{ \tilde G }[/math].
Выходные данные:
    для каждой вершины v ∈ V – набор вершин T(v),
        так что транзитивное замыкание G состоит из рёбер (v, w), v ∈ V, w ∈ T(v).
        
for each v ∈ V do T(v) := { v }
for each v ∈ [math]\displaystyle{ \tilde V }[/math]:
    for each w ∈ [math]\displaystyle{ \tilde T(v) }[/math]:
        T(v) := T(v) ∪ SCC(w)
    for each x ∈ SCC(v):
        T(x) := T(v)    /* присваивание по ссылке */

либо транзитивное замыкание может строиться по упакованным данным [math]\displaystyle{ \tilde T(v) }[/math] одной из следующих функций:

Входные данные
    граф G с вершинами V;
    компоненты сильной связности SCC(v) графа G;
    отображение R(v) вершин графа G на вершины графа [math]\displaystyle{ \tilde G }[/math];
    граф [math]\displaystyle{ \tilde G }[/math] с вершинами [math]\displaystyle{ \tilde V }[/math];
    транзитивное замыкание [math]\displaystyle{ \tilde T }[/math] графа [math]\displaystyle{ \tilde G }[/math].
    
function transitive_closure(v):
    T := { v }
    for each w ∈ [math]\displaystyle{ \tilde T(R(v)) }[/math]:
        T := T ∪ SCC(w)
    return T
    
function is_in_transitive_closure(v, w):
    return R(w) ∈ [math]\displaystyle{ \tilde T(R(v)) }[/math]

Последовательная сложность алгоритма

Первый и второй этап выполняются с помощью поиска в глубину со сложностью [math]\displaystyle{ O(m) }[/math].

На третьем этапе основой операцией является объединение списков вершин. В случае хранения списков в отсортированном виде объединение выполняется за линейное время. Количество списков не превосходит [math]\displaystyle{ n }[/math], а в каждом списке не более [math]\displaystyle{ \mu }[/math] вершин, где [math]\displaystyle{ \mu }[/math] – количество компонент сильной связности. Общая сложность тогда составляет [math]\displaystyle{ O(\mu^2) }[/math]. Альтернативным форматов хранения списка вершин является битовая маска с такой же общей сложностью.

Сложность четвёртого этапа составляет [math]\displaystyle{ O(\mu n) }[/math], так как для каждой из [math]\displaystyle{ \mu }[/math] компонент сильной связности за линейное время вычисляется список вершин из не более чем [math]\displaystyle{ n }[/math] вершин. Поскольку компоненты сильной связности не пересекаются, на данном этапе уже не требуется хранить списки в отсортированном виде.

Таким образом, общая сложность составляет [math]\displaystyle{ O(m + \mu^2) }[/math], если не требуется явное построение транзитивного замыкания, или [math]\displaystyle{ O(m + \mu n) }[/math] в противном случае.

Информационный граф

Ресурс параллелизма алгоритма

Входные и выходные данные алгоритма

Свойства алгоритма

Программная реализация алгоритма

Особенности реализации последовательного алгоритма

Локальность данных и вычислений

Локальность реализации алгоритма

Структура обращений в память и качественная оценка локальности
Количественная оценка локальности

Возможные способы и особенности параллельной реализации алгоритма

Программа, реализующая поиск транзитного замыкания, состоит CPU части, отвечающей за общую координацию вычислений, использующей вспомогательные классы.

Масштабируемость алгоритма и его реализации

Масштабируемость алгоритма

Масштабируемость реализации алгоритма

Динамические характеристики и эффективность реализации алгоритма

Выводы для классов архитектур

Существующие реализации алгоритма

Литература

  1. ↑ Purdom, Paul, Jr. “A Transitive Closure Algorithm.” Bit 10, no. 1 (March 1970): 76–94. doi:10.1007/BF01940892.
  2. ↑ 2,0 2,1 Tarjan, Robert. “Depth-First Search and Linear Graph Algorithms.” SIAM Journal on Computing 1, no. 2 (1972): 146–60.
  3. ↑ Kahn, A B. “Topological Sorting of Large Networks.” Communications of the ACM 5, no. 11 (November 1962): 558–62. doi:10.1145/368996.369025.