Участник:Denemmy/Partitioning Around Medoids (Алгоритм)

Материал из Алговики
Перейти к навигации Перейти к поиску

Авторы: Галеев Д.Ф, Запутляев И.

Свойства и структура алгоритма

Общее описание алгоритма

Кластеризация - это задача из области машинного обучения, которая заключается в том, что нужно выделить некоторое число групп в исходном множестве, в каждой из которых содержатся схожие по некоторой метрике элементы.
Partitioning Around Medoids (PAM) - это одна из реализаций алгоритма кластеризации k-medoids. PAM использует жадный алгоритм, который может не найти оптимального решения, однако он гораздо быстрее полного перебора.

Математическое описание алгоритма

Вычислительное ядро алгоритма

Макроструктура алгоритма

Схема реализации последовательного алгоритма

Псевдокод алгоритма:

1  функция PAM(D, k, tmax=100):
2      # D - матрица расстояний, k - число кластеров, tmax - маскимальное число итераций
3      выполнить фазу BUILD, получить множество метоидов M и множество не-метоидов L
4      вычислить значение целевой функции F
5      для t = 0..tmax-1:
6          выполнить фазу SWAP, вычислить значение целевой функции F'
7          delta = F' - F
8          если delta > 0:
9              обновить множества M и L
10             F = F'
11         иначе:
12             выйти из цикла
13     вернуть М

Последовательная сложность алгоритма

Обозначим количество кластеров как [math]\displaystyle{ K }[/math], а количество объектов как [math]\displaystyle{ N }[/math].

На стадии BUILD каждый шаг нахождения очередного метоида имеет сложность [math]\displaystyle{ O(N^2) }[/math] по количеству операций сложения вещественных чисел и по количеству операций сравнения двух вещественных чисел.
Тогда стадия BUILD имеет сложность [math]\displaystyle{ O(K*N^2) }[/math]

На стадии SWAP вычисление целевой функции имеет сложность [math]\displaystyle{ O(K*N^2) }[/math] по количеству операций сложения вещественных чисел и по количеству операций сравнения двух вещественных чисел.

Таким образом алгоритм PAN имеет сложность [math]\displaystyle{ O(K*N^2) }[/math]

Информационный граф

Ресурс параллелизма алгоритма

Входные и выходные данные алгоритма

Свойства алгоритма

Программная реализация алгоритма

Особенности реализации последовательного алгоритма

Локальность данных и вычислений

Локальность реализации алгоритма

Структура обращений в память и качественная оценка локальности
Количественная оценка локальности

Возможные способы и особенности параллельной реализации алгоритма

Масштабируемость алгоритма и его реализации

Масштабируемость алгоритма

Масштабируемость реализации алгоритма

Динамические характеристики и эффективность реализации алгоритма

Выводы для классов архитектур

Существующие реализации алгоритма

Открытое программное обеспечение

Проприетарное программное обеспечение

Литература