Участник:Dmitry/Плотностный алгоритм кластеризации

Материал из Алговики
Перейти к навигации Перейти к поиску

Авторы описания: Титов Д.Е.

Свойства и структура алгоритма

Общее описание алгоритма

Под кластеризацией понимается деление заданного множества точек данных (объектов) на подгруппы, каждая из которых, насколько это возможно, однородна. В основе метода кластеризации DBSCAN лежит объединение некоторых объектов в соответствии с их внутригрупповым «соединением». Для проведения корректной процедуры кластеризации необходимо указать критерии, по которым объекты будут объединены в кластеры. Прежде всего, необходимо сказать, что кластеры представляют собой плотные области некоторых объектов в пространстве данных, разделенных между собой объектами, плотность которых значительно ниже. Расположение точек в одном кластере обусловлено их соединением, т.е. некоторой связью между собой.

Математическое описание алгоритма

Плотность точек для данной точки [math]\displaystyle{ X }[/math] определяется двумя параметрами. Первым из них является [math]\displaystyle{ \varepsilon }[/math] – радиус «соседства» (приближенности) точки [math]\displaystyle{ X }[/math]. Тогда множество [math]\displaystyle{ M_\varepsilon(X) }[/math] будет включать в себя такие точки [math]\displaystyle{ f_i }[/math], [math]\displaystyle{ (i=\overline{1,n}) }[/math], для которых следующее неравенство будет истинно:

[math]\displaystyle{ dist(X,f_i) \le \varepsilon }[/math], [math]\displaystyle{ (i=\overline{1,n}) }[/math]

Функция [math]\displaystyle{ dist(var1, var2) }[/math] определяет расстояние между объектами выборки [math]\displaystyle{ D }[/math]. Это расстояние может вычисляться различными способами, например, как евклидово расстояние или с помощью метрики Минковского.

Вторым параметром определения плотности точек является [math]\displaystyle{ MCP }[/math] – это минимальное количество точек, которые расположены ближе всего к данной точке согласно определенному радиусу [math]\displaystyle{ \varepsilon }[/math].

Точка [math]\displaystyle{ f_i }[/math], [math]\displaystyle{ (i=\overline{1,n}) }[/math] будет являться окруженной точкой (согласно [math]\displaystyle{ \varepsilon }[/math] и [math]\displaystyle{ MCP }[/math]) если:

[math]\displaystyle{ M_\varepsilon(X) \le MPC }[/math]

Это значит, что точка [math]\displaystyle{ f_i }[/math], [math]\displaystyle{ (i=\overline{1,n}) }[/math] окруженная, если количество «соседствующих» точек выборки [math]\displaystyle{ D }[/math] окажется большим, либо равным значению параметра [math]\displaystyle{ MCP }[/math] (рис. 1).

Рис. 1. Окруженная точка при MPC = 5

Точка [math]\displaystyle{ X }[/math] является прямо достижимой по плотности от точки [math]\displaystyle{ f }[/math] (при соответствующих [math]\displaystyle{ \varepsilon }[/math] и [math]\displaystyle{ MPC }[/math]), если точка [math]\displaystyle{ X \in M(X) }[/math], т.е. точка [math]\displaystyle{ X }[/math] – это одна из точек [math]\displaystyle{ f }[/math] для другого окружения (соседства), где [math]\displaystyle{ f }[/math] – окруженная точка (рис. 2).

Рис. 2. Точка X прямо достижима по плотности от точки f

Достижимость по плотности – это транзитивное замыкание прямо достижимой по плотности точки. Точка [math]\displaystyle{ f }[/math] достижима по плотности из точки [math]\displaystyle{ X }[/math], но точка [math]\displaystyle{ X }[/math] не достижима по плотности из точки [math]\displaystyle{ f }[/math] (рис. 3).

Рис. 3. Достижимость по плотности

Точка [math]\displaystyle{ X }[/math] соединена (связана) по плотности с точкой [math]\displaystyle{ f }[/math] (согласно [math]\displaystyle{ \varepsilon }[/math] и [math]\displaystyle{ MCP }[/math]) если существует точка [math]\displaystyle{ e }[/math] такая, что обе точки [math]\displaystyle{ X }[/math] и [math]\displaystyle{ f }[/math] являются достижимыми от точки [math]\displaystyle{ e }[/math] (согласно [math]\displaystyle{ \varepsilon }[/math] и [math]\displaystyle{ MCP }[/math]) (рис. 4).

Рис. 4. Соединение по плотности

Кластер, сформированный на основе размещения объектов по плотности должен удовлетворять таким свойствам: максимальность; связность.

В этом случае, под кластером понимается непустое подмножество точек [math]\displaystyle{ G }[/math] из набора данных [math]\displaystyle{ D }[/math], которое удовлетворяет вышеупомянутым свойствам, причем, максимальность интерпретируется таким образом: если [math]\displaystyle{ X \in G }[/math] и [math]\displaystyle{ f }[/math] достижима по плотности от точки [math]\displaystyle{ X }[/math], тогда и [math]\displaystyle{ f \in G }[/math], это значит, что обе точки принадлежат одному кластеру.

Свойство связности гласит, что каждый объект в подмножестве [math]\displaystyle{ G }[/math] соединен по плотности со всеми объектами кластера (при заданных [math]\displaystyle{ \varepsilon }[/math] и [math]\displaystyle{ MCP }[/math]).

Все объекты из набора данных [math]\displaystyle{ D }[/math] представляют собой совокупность подмножеств:

[math]\displaystyle{ D= \{ G_1, G_2,..., G_n, N \} }[/math],

где [math]\displaystyle{ G_1, G_2,..., G_n }[/math] – кластеры, образованные по плотности; [math]\displaystyle{ N }[/math] – некоторое подмножество, объекты которого не принадлежат ни одному из подмножеств [math]\displaystyle{ G_1, G_2,..., G_n }[/math].

Вычислительное ядро алгоритма

Вычислительным ядром алгоритма является поиск всех "соседствующих" точек для каждой точки [math]\displaystyle{ X }[/math] входного множества [math]\displaystyle{ D }[/math]. Основное время работы алгоритма используется на функцию [math]\displaystyle{ dist(var1, var2) }[/math], определяющую расстояние между объектами выборки [math]\displaystyle{ D }[/math] и сравнение расстояния с заданной [math]\displaystyle{ \varepsilon }[/math] для того, чтобы определить "соседствующие" точки.

Макроструктура алгоритма

Схема реализации последовательного алгоритма

Последовательная сложность алгоритма

Информационный граф

Ресурс параллелизма алгоритма

Входные и выходные данные алгоритма

Свойства алгоритма

Программная реализация алгоритма

Особенности реализации последовательного алгоритма

Локальность данных и вычислений

Возможные способы и особенности параллельной реализации алгоритма

Масштабируемость алгоритма и его реализации

Динамические характеристики и эффективность реализации алгоритма

Выводы для классов архитектур

Существующие реализации алгоритма

Литература