Участник:Руфина Третьякова/Хранение ненулевых элементов разреженных матриц. Умножение разреженной матрицы на вектор
| Умножение разреженной матрицы на вектор | |
| Последовательный алгоритм | |
| Последовательная сложность | [math]\displaystyle{ }[/math] |
| Объём входных данных | [math]\displaystyle{ }[/math] |
| Объём выходных данных | [math]\displaystyle{ }[/math] |
| Параллельный алгоритм | |
| Высота ярусно-параллельной формы | [math]\displaystyle{ }[/math] |
| Ширина ярусно-параллельной формы | [math]\displaystyle{ }[/math] |
Авторы статьи: Третьякова Р. М. (группа 603), Буторина Е. В. (группа 603)
Свойства и структура алгоритма
Общее описание алгоритма
Разрежённая матрица — это матрица с преимущественно нулевыми элементами. В противном случае, если бо́льшая часть элементов матрицы ненулевые, матрица считается плотной. Среди специалистов нет единства в определении того, какое именно количество ненулевых элементов делает матрицу разрежённой. Разные авторы предлагают различные варианты. Огромные разрежённые матрицы часто возникают при решении таких задач, как дифференциальное уравнение в частных производных. При хранении и преобразовании разрежённых матриц в компьютере бывает полезно, а часто и необходимо, использовать специальные алгоритмы и структуры данных, которые учитывают разрежённую структуру матрицы. Операции и алгоритмы, применяемые для работы с обычными, плотными матрицами, применительно к большим разрежённым матрицам работают относительно медленно и требуют значительных объёмов памяти. Однако разрежённые матрицы могут быть легко сжаты путём записи только своих ненулевых элементов, что снижает требования к компьютерной памяти.
Математическое описание алгоритма
Исходные данные: разреженная матрица [math]\displaystyle{ M^{n*n} }[/math], вектор [math]\displaystyle{ x^{n*1} }[/math]
Рассмотрим CSR-представление разреженных матриц
CSR-формат представляет матрицу [math]\displaystyle{ M }[/math] в виде 3-х одномерных массивов:
массив [math]\displaystyle{ A }[/math] содержит ненулевые значения матрицы, [math]\displaystyle{ JA }[/math] - номера столбцов ненулевых элементов., [math]\displaystyle{ IA }[/math]- содержит номер с которого начинается описание элементов в массивах, Этот формат позволяет быстро производить перемножение матрицы [math]\displaystyle{ M }[/math] на вектор [math]\displaystyle{ x }[/math].
Например, матрица
- [math]\displaystyle{ \begin{pmatrix} 0 & 0 & 0 & 0 \\ 5 & 8 & 0 & 0 \\ 0 & 0 & 3 & 0 \\ 0 & 6 & 0 & 0 \\ \end{pmatrix} }[/math]
это Шаблон:Math разреженная матрица с 4-мя ненулевыми элементами, представляемая в формате CSR
A = [ 5 8 3 6 ] IA = [ 0 0 2 3 4 ] JA = [ 0 1 2 1 ]
Вычисляемые данные: вектор [math]\displaystyle{ M*x }[/math]=[math]\displaystyle{ c }[/math]
Вычислительное ядро алгоритма
- [math]\displaystyle{ y_i = \sum_{k = ia_i}^{ia_{i+1}} a_k x_{ja_k} }[/math]
Макроструктура алгоритма
Псевдокод алгоритма:
Входные данные:
число строк матрицы n;
разреженная матрица в формате CSR:
строчные указатели IA,
столбцовые указателиJA,
ненулевые элементы A;
вектор x.
Выходные данные: произведение матрицы на вектор y.
Q := new priority queue
for i = 1,n:
for k = IA(i), IA(i+1)-1:
y(i) += A(k)*x(JA(k));
Схема реализации последовательного алгоритма
Метод можно описать следующим образом:
Последовательная сложность алгоритма
Для вычисления сингулярных чисел и векторов матрицы порядка n в последовательном варианте требуется:
- [math]\displaystyle{ }[/math] делений,
- [math]\displaystyle{ }[/math] сложений (вычитаний),
- [math]\displaystyle{ }[/math] умножений.
Информационный граф
Ресурс параллелизма алгоритма
Входные и выходные данные алгоритма
Свойства алгоритма
Программная реализация алгоритма
Масштабируемость алгоритма и его реализации
Существующие реализации алгоритма
Литература
1. С. Писсанецки Технология разреженных матриц. Изд. Мир, 1988.